Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTCH1Q13635 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTCH1Q13635 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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