Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL4BQ13620 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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