Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CUL1Q13616 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CUL1Q13616 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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