Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF5Q13568 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms