Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms