Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC1Q13547 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HDAC1Q13547 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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