Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTM1Q13496 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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