Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMS2P3Q13401 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms