Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3BPQ13352 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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