Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME3Q13232 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME3Q13232 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NME3Q13232 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME3Q13232 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME3Q13232 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME3Q13232 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME3Q13232 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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