Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CHAF1BQ13112 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHAF1BQ13112 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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