Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPS1Q13098 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPS1Q13098 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPS1Q13098 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPS1Q13098 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPS1Q13098 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPS1Q13098 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPS1Q13098 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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