Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF1Q13077 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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TRAF1Q13077 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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TRAF1Q13077 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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TRAF1Q13077 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF1Q13077 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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