Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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