Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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