Protein–RNA interactions for Protein: Q12979

ABR, Active breakpoint cluster region-related protein, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRQ12979 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRQ12979 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRQ12979 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABRQ12979 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABRQ12979 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRQ12979 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABRQ12979 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABRQ12979 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRQ12979 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRQ12979 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABRQ12979 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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