Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.026e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 514.07□□□□□ -0.161e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-213ENST00000456976 720 ntTSL 511.9□□□□□ -0.51e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 511.9□□□□□ -0.51e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-204ENST00000418897 583 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-208ENST00000428098 817 ntTSL 311.89□□□□□ -0.511e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-205ENST00000419020 583 ntTSL 311.6□□□□□ -0.551e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-209ENST00000428450 633 ntTSL 411.51□□□□□ -0.571e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 ATP6V1G2-DDX39B-203ENST00000480131 552 ntAPPRIS P1 TSL 411.09□□□□□ -0.631e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.641e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 210.78□□□□□ -0.681e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.861e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 56.62□□□□□ -1.351e-9■■■■□ 21
ILF3Q12906 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.058e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 NPAS2-204ENST00000448812 774 ntTSL 511.05□□□□□ -0.648e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 37.34□□□□□ -1.238e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 NPAS2-209ENST00000486017 764 ntTSL 36.19□□□□□ -1.428e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 NPAS2-211ENST00000492373 552 ntTSL 45.06□□□□□ -1.68e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.25□□□□□ -2.051e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.685e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-7■■■■□ 21
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ILF3Q12906 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.015e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.15e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.315e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 SPATS2-214ENST00000549412 2781 ntTSL 220.18■□□□□ 0.829e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.429e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.479e-7■■■■□ 21
ILF3Q12906 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.259e-7■■■■□ 21
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ILF3Q12906 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 55.74□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 21
ILF3Q12906 RPSA-203ENST00000444512 701 ntTSL 218.79■□□□□ 0.62e-12■■■■□ 21
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ILF3Q12906 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 211.24□□□□□ -0.612e-12■■■■□ 21
ILF3Q12906 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-12■■■■□ 21
ILF3Q12906 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-12■■■■□ 21
ILF3Q12906 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 514.09□□□□□ -0.152e-9■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.031e-323■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.329e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 RPS6KA3-204ENST00000474266 930 ntTSL 311.72□□□□□ -0.538e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 ELP2-204ENST00000423854 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.649e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.669e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 ELP2-201ENST00000350494 2487 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.689e-8■■■■□ 20.9
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ILF3Q12906 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.929e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 ELP2-205ENST00000442325 2722 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -19e-8■■■■□ 20.9
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ILF3Q12906 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.826e-7■■■■□ 20.9
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ILF3Q12906 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 MCU-209ENST00000604679 1074 ntTSL 513.61□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 20.9
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ILF3Q12906 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 MCU-206ENST00000603649 473 ntTSL 510.6□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 EHBP1-201ENST00000263991 5165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.412e-7■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.62e-7■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.692e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 AGPS-204ENST00000637633 2143 ntTSL 54.62□□□□□ -1.672e-6■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 P4HB-211ENST00000477607 1110 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.053e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 P4HB-212ENST00000478034 811 ntTSL 214.42□□□□□ -0.13e-8■■■■□ 20.9
ILF3Q12906 KLK1-203ENST00000593859 992 ntTSL 217.07■□□□□ 0.328e-8■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-8■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 KLK1-202ENST00000593325 1854 ntTSL 213.01□□□□□ -0.338e-8■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.589e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-207ENST00000477369 728 ntTSL 56.2□□□□□ -1.423e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-202ENST00000378593 430 ntTSL 54.52□□□□□ -1.693e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-205ENST00000425658 513 ntTSL 54.47□□□□□ -1.693e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.772e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 518.44■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)17.78■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 DUSP16-203ENST00000536236 258 ntTSL 35.88□□□□□ -1.471e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 DUSP16-205ENST00000541207 585 ntTSL 45.36□□□□□ -1.551e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 DUSP16-204ENST00000539940 566 ntTSL 45.21□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-8■■■■□ 20.8
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