Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RAB40BQ12829 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB40BQ12829 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB40BQ12829 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RAB40BQ12829 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB40BQ12829 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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