Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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