Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 AIM32YML050W 936 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SAS2YMR127C 1017 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 CTL1YMR180C 963 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YMR181CYMR181C 465 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YBL055CYBL055C 1257 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 CSH1YBR161W 1131 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ERV15YBR210W 429 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 KAR4YCL055W 1008 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 STH1YIL126W 4080 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SDC25YLL016W 3147 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 KSP1YHR082C 3090 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 RTG3YBL103C 1461 nt2.03□□□□□ -2.08
USB1Q12208 MFA1YDR461W 111 nt2.03□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ERG25YGR060W 930 nt2.03□□□□□ -2.08
USB1Q12208 GRX7YBR014C 612 nt2.03□□□□□ -2.08
USB1Q12208 TFB6YOR352W 1032 nt2.03□□□□□ -2.08
USB1Q12208 MSB1YOR188W 3414 nt2.03□□□□□ -2.08
USB1Q12208 MLH1YMR167W 2310 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 AFI1YOR129C 2682 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SMC6YLR383W 3345 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 TRS130YMR218C 3309 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 LSM4YER112W 564 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 RPL6BYLR448W 531 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 ALG14YBR070C 714 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YJL181WYJL181W 1836 nt2.02□□□□□ -2.09
USB1Q12208 NOP56YLR197W 1515 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 VTC3YPL019C 2508 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 JJJ2YJL162C 1752 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 EMI1YDR512C 564 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YFH7YFR007W 1062 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YMR320WYMR320W 306 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 END3YNL084C 1050 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 FMP41YNL168C 780 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 PEX15YOL044W 1152 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YBL108WYBL108W 306 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 GCY1YOR120W 939 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 BAG7YOR134W 1230 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 IRC13YOR235W 315 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 snR35snR35 204 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 MBA1YBR185C 837 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 UTP15YMR093W 1542 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SYO1YDL063C 1863 nt2.01□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SEM1YDR363W-A 270 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 GET1YGL020C 708 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 ARG3YJL088W 1017 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 NNF1YJR112W 606 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YKR070WYKR070W 1059 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 BOS1YLR078C 735 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 NGL1YOL042W 1092 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 ALY1YKR021W 2748 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 DSE1YER124C 1722 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 RGL1YPL066W 1440 nt2□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SLN1YIL147C 3663 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 TOR2YKL203C 7425 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YMR046CYMR046C 1323 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SCP160YJL080C 3669 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 NUP100YKL068W 2880 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YCR016WYCR016W 873 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 snR76snR76 109 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 PLP1YDR183W 693 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 CPR5YDR304C 678 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SAE2YGL175C 1038 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YGL204CYGL204C 306 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 VEL1YGL258W 621 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 TWF1YGR080W 999 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 RTS3YGR161C 792 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 IKI1YHR187W 930 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 ASG7YJL170C 630 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 JID1YPR061C 906 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 UBS1YBR165W 834 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YIL080WYIL080W 4722 nt1.99□□□□□ -2.09
USB1Q12208 OSW7YFR039C 1533 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 SNU114YKL173W 3027 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 MDM36YPR083W 1740 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 PAU14YIL176C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YJL202CYJL202C 348 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 PAU1YJL223C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 TMA10YLR327C 261 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 UFE1YOR075W 1041 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 CCL1YPR025C 1182 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 DAD3YBR233W-A 285 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 snR44snR44 211 nt1.98□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YER107W-AYER107W-A 321 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YFL015CYFL015C 495 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 PEX4YGR133W 552 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YHR212CYHR212C 336 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 PSY1YKL076C 384 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 NYV1YLR093C 762 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YAR060CYAR060C 336 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YML090WYML090W 387 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 DLT1YMR126C 1029 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 YRO2YBR054W 1035 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 GCD2YGR083C 1956 nt1.97□□□□□ -2.09
USB1Q12208 FUS1YCL027W 1539 nt1.96□□□□□ -2.09
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