Protein–RNA interactions for Protein: Q12113

TY2B-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-OR1Q12113 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 YCL019WYCL019W 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 NPR1YNL183C 2373 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 SPH1YLR313C 1593 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 YEL1YBL060W 2064 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 RPN5YDL147W 1338 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 CDC25YLR310C 4770 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 RRP42YDL111C 798 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 YGL069CYGL069C 465 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 MRE11YMR224C 2079 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 RRP8YDR083W 1179 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 HCH1YNL281W 462 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 MCT1YOR221C 1083 nt1.75□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 SPE1YKL184W 1401 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 HFM1YGL251C 3564 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 FRQ1YDR373W 573 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 ENP2YGR145W 2124 nt1.74□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 ISW2YOR304W 3363 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 RAV2YDR202C 1056 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 TIM9YEL020W-A 264 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 YGL117WYGL117W 798 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 VMA10YHR039C-A 345 nt1.73□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 YHR097CYHR097C 1101 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 TRM112YNR046W 408 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 SLM4YBR077C 489 nt1.72□□□□□ -2.13
TY2B-OR1Q12113 YMR1YJR110W 2067 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 PET309YLR067C 2898 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YER067C-AYER067C-A 324 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 MIG2YGL209W 1149 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 HKR1YDR420W 5409 nt1.71□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 DFG16YOR030W 1860 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 TCM62YBR044C 1719 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 RNA1YMR235C 1224 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 FMP16YDR070C 282 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 RTT105YER104W 627 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 BUR6YER159C 429 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YGR242WYGR242W 309 nt1.7□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 NDC80YIL144W 2076 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 STP1YDR463W 1560 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 MET18YIL128W 3099 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 RPS0BYLR048W 759 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 SVS1YPL163C 783 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YJL070CYJL070C 2667 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 NOP56YLR197W 1515 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 IST2YBR086C 2841 nt1.69□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 SEC15YGL233W 2733 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 CBP6YBR120C 489 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 UTP6YDR449C 1323 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 URB2YJR041C 3525 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 SPS2YDR522C 1509 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 PUF2YPR042C 3228 nt1.68□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 ARP10YDR106W 855 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YDR115WYDR115W 318 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 PAM16YJL104W 450 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 PRP16YKR086W 3216 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 RKM1YPL208W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 HTD2YHR067W 843 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 MSL1YIR009W 336 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YNL203CYNL203C 612 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 SRO9YCL037C 1305 nt1.67□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 UBP16YPL072W 1500 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YSP1YHR155W 3687 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 CIK1YMR198W 1785 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YGR237CYGR237C 2358 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 ARG2YJL071W 1725 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 ALE1YOR175C 1860 nt1.66□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 YBR089WYBR089W 600 nt1.65□□□□□ -2.14
TY2B-OR1Q12113 RLF2YPR018W 1821 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 GAS2YLR343W 1668 nt1.65□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YPR078CYPR078C 1119 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 TAZ1YPR140W 1146 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 ULP2YIL031W 3105 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 ATP25YMR098C 1839 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 SPP382YLR424W 2127 nt1.64□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 MAD1YGL086W 2250 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 VHR1YIL056W 1923 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 GPI17YDR434W 1605 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 SCC2YDR180W 4482 nt1.63□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YNL046WYNL046W 519 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 ATX2YOR079C 942 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 PHO5YBR093C 1404 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 PRP18YGR006W 756 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 HAL1YPR005C 885 nt1.62□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 RIX1YHR197W 2292 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 MYO2YOR326W 4725 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 IRC6YFR043C 714 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YLR366WYLR366W 306 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YMR321CYMR321C 318 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 PTC5YOR090C 1719 nt1.61□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 RLP24YLR009W 600 nt1.6□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 FMC1YIL098C 468 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YJL119CYJL119C 324 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 YPL071CYPL071C 471 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 VMR1YHL035C 4779 nt1.59□□□□□ -2.15
TY2B-OR1Q12113 UTP25YIL091C 2166 nt1.59□□□□□ -2.16
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