Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPAL4Q0D2K0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms