Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ABCC8Q09428 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ABCC8Q09428 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms