Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDR1Q08345 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms