Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DHX9Q08211 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms