Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP3CAQ08209 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms