Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP1Q07960 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms