Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SOS1Q07889 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOS1Q07889 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms