Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LTBQ06643 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBQ06643 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LTBQ06643 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBQ06643 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBQ06643 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBQ06643 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms