Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRIN1Q05586 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN1Q05586 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms