Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN12Q05209 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN12Q05209 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms