Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YCK2YNL154C 1641 nt2.66□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 SOK1YDR006C 2706 nt2.66□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 MSH4YFL003C 2637 nt2.66□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 YGL176CYGL176C 1665 nt2.66□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 YEF3YLR249W 3135 nt2.66□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 ART10YLR392C 1557 nt2.66□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 GDI1YER136W 1356 nt2.65□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 SGM1YJR134C 2124 nt2.65□□□□□ -1.98
UBX2Q04228 PEX14YGL153W 1026 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YGL159WYGL159W 1113 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YGR111WYGR111W 1203 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 INP1YMR204C 1263 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YNL043CYNL043C 321 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 THI80YOR143C 960 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 ATP3YBR039W 936 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 UTP22YGR090W 3714 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MUB1YMR100W 1863 nt2.65□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 CSF1YLR087C 8877 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 DPP1YDR284C 870 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YGL117WYGL117W 798 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YJL169WYJL169W 369 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 VPS51YKR020W 495 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MST28YAR033W 705 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RPL20AYMR242C 519 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 DIA1YMR316W 1011 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YBL062WYBL062W 381 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 PEX17YNL214W 600 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SME1YOR159C 285 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MSS18YPR134W 807 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 AI2Q0055 2565 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 EDS1YBR033W 2760 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.64□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SPF1YEL031W 3648 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 HMO1YDR174W 741 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SEC4YFL005W 648 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 DSE2YHR143W 978 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YKL131WYKL131W 522 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 PRM6YML047C 1059 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 PDR17YNL264C 1053 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 INO4YOL108C 456 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 PSK1YAL017W 4071 nt2.63□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 DSE4YNR067C 3354 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RGR1YLR071C 3249 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RPN9YDR427W 1182 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 DIG2YDR480W 972 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 GCN4YEL009C 846 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YGL242CYGL242C 546 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 ERG25YGR060W 930 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 TCD1YHR003C 1290 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 BAT1YHR208W 1182 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MCR1YKL150W 909 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RPF2YKR081C 1035 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 ACM1YPL267W 630 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MDM36YPR083W 1740 nt2.62□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RIM13YMR154C 2184 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YPK1YKL126W 2043 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 AVT2YEL064C 1443 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SWR1YDR334W 4545 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SSD1YDR293C 3753 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SHR3YDL212W 633 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 CUP1-1YHR053C 186 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 CUP1-2YHR055C 186 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 CDC123YLR215C 1083 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 UBC12YLR306W 567 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MPD2YOL088C 834 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 TYE7YOR344C 876 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YPL039WYPL039W 951 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YBR209WYBR209W 318 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 TRM82YDR165W 1335 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 ATP22YDR350C 2055 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SSE1YPL106C 2082 nt2.61□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 GYP5YPL249C 2685 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YPD1YDL235C 504 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 COG7YGL005C 840 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 EMP24YGL200C 612 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 VMA10YHR039C-A 345 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YHR212CYHR212C 336 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 RPL17BYJL177W 555 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 YAR060CYAR060C 336 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 ADI1YMR009W 540 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SAS2YMR127C 1017 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 TMA64YDR117C 1698 nt2.6□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 PSY2YNL201C 2577 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 KHA1YJL094C 2622 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 PEX8YGR077C 1770 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 NOP56YLR197W 1515 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 FAB1YFR019W 6837 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 MAM1YER106W 909 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 SRL3YKR091W 741 nt2.59□□□□□ -1.99
UBX2Q04228 ERV41YML067C 1059 nt2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms