Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TGFBR3Q03167 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TGFBR3Q03167 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms