Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX2Q02962 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms