Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB1Q02641 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB1Q02641 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms