Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 SEN54YPL083C 1404 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 RSN1YMR266W 2862 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 FAA2YER015W 2235 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SPO14YKR031C 5052 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 CDC55YGL190C 1581 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 PBP4YDL053C 558 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 DTD1YDL219W 453 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 RPL17AYKL180W 555 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 CWC24YLR323C 780 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 RPS16AYMR143W 432 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YOL057WYOL057W 2136 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 ARL3YPL051W 597 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 NIP7YPL211W 546 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 snR42snR42 351 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YBR300CYBR300C 498 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YPR022CYPR022C 3402 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 REC8YPR007C 2043 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 KAP104YBR017C 2757 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 PCK1YKR097W 1650 nt2.76□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 TAO3YIL129C 7131 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YCL020WYCL020W 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YCR090CYCR090C 549 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 MND1YGL183C 660 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YGR053CYGR053C 852 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SDO1YLR022C 753 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 RRT16YNL105W 429 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YOR152CYOR152C 771 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 HEM4YOR278W 828 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YPR014CYPR014C 330 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YHR080CYHR080C 4038 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YLR108CYLR108C 1458 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 CCT7YJL111W 1653 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SOK1YDR006C 2706 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 REF2YDR195W 1602 nt2.75□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 UTP15YMR093W 1542 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SSP1YHR184W 1716 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 NDT80YHR124W 1884 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 APC11YDL008W 498 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDL032WYDL032W 312 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDR042CYDR042C 603 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YCL007CYCL007C 393 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 ITC1YGL133W 3795 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 PSY2YNL201C 2577 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 MMS1YPR164W 4224 nt2.74□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 NMA111YNL123W 2994 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDL163WYDL163W 303 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 ERG28YER044C 447 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 AIM19YIL087C 474 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YIL175WYIL175W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 PIS1YPR113W 663 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 snR191snR191 274 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YER138CYER138C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YER160CYER160C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YJR027WYJR027W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YML039WYML039W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YML045WYML045W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YMR050CYMR050C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 GCD6YDR211W 2139 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 TIM11YDR322C-A 291 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SNO3YFL060C 669 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YGR226CYGR226C 210 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 AIM18YHR198C 966 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YHR213WYHR213W 597 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 TDA8YAL064C-A 381 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 RPL8BYLL045C 771 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 APC9YLR102C 798 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YAR062WYAR062W 597 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 COX8YLR395C 237 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SEC14YMR079W 915 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YNL235CYNL235C 432 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SNO2YNL334C 669 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 ATG3YNR007C 933 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 CSR2YPR030W 3366 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 TRA1YHR099W 11235 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SRC1YML034W 2505 nt2.72□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 YEL1YBL060W 2064 nt2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms