Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLCB3Q01970 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms