Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM2Q00987 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM2Q00987 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms