Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXC5Q00444 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXC5Q00444 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms