Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX1P83916 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX1P83916 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX1P83916 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBX1P83916 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX1P83916 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX1P83916 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX1P83916 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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