Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRB1P82279 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRB1P82279 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CRB1P82279 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRB1P82279 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRB1P82279 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRB1P82279 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CRB1P82279 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CRB1P82279 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms