Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ELF3P78545 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ELF3P78545 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELF3P78545 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELF3P78545 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELF3P78545 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ELF3P78545 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ELF3P78545 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ELF3P78545 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ELF3P78545 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms