Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CTAG1AP78358 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTAG1AP78358 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms