Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASIC1P78348 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms