Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HBBP68871 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HBBP68871 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HBBP68871 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HBBP68871 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HBBP68871 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms