Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK2A1P68400 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CSNK2A1P68400 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms