Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RHOBP62745 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RHOBP62745 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RHOBP62745 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RHOBP62745 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms