Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMC1P62191 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMC1P62191 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms