Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB25P57735 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB25P57735 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB25P57735 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms