Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB4P54760 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHB4P54760 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms